超级疫毒“金美拉”和抗生素在运送途中，被恐怖组织头目SeanAmbrose（DougrayScott饰）盗走，EthanHunt（TomCruise饰）率领他的IMF小组接受中情局的任务，找回疫毒。这次，EthanHunt找到了女飞贼NyahNordoff-Hall（ThandieNewton饰）搭档，后者是SeanAmbrose的前女友。EthanHunt在获取Nyah信任的同时，二人也暗生情愫。但是，为了完成任务，EthanHunt不得不安排Nyah回到SeanAmbrose身边卧底。Nyah终于打探出疫毒所在的药厂，接获情报的EthanHunt前往药厂准备销毁疫毒；另一边，SeanAmbrose已经察觉出了Nyah回到自己身边的真正目的，组织人马在药厂等待EthanHunt自投罗网。激烈的搏斗中，Nyah为了帮助EthanHunt完成任务，将疫毒注入了自己体内，只有在20个小时之内将抗生素注入Nyah体内，才能挽救她的性命，EthanHunt又将面临不可能的任务。影片中的夺命病毒的确很瘆人，围绕病毒和解药展开一系列的阴谋、杀戮、对战与拯救，让影片呈现出一幕幕高潮和精彩。对比第一部影片，本片在很多地方都有很大的长进，惊险和精彩程度也更胜一筹吴宇森创造的暴力美学，精彩夺目。有赖吴宇森执导，第二部少了些硬碰硬的强悍，更多一些别出心裁的用心设计，甚至有点江湖侠义的味道！,无论是热烈奔放的弗罗明格，或是豪车间宛如与美女调情般的追逐，即使动作设计，也充满其他各集少有的东方式浪漫唯美。吴宇森动作戏的掌镜功力，却使得本片在动作戏超越前部很多，慢镜头、放鸽子、转身拔枪、肉搏格斗等招牌动作，一一呈现在眼前。特别是后面的枪战、爆炸、追车、狙击等等眼花缭乱，看的不亦乐乎。